Daftar Lembaga Madrasah Tsanawiyah (MTs) se-NTT
| No | NSM | NPSN | Nama Madrasah | Status | Alamat | Kelurahan | Kecamatan | Kabupaten |
| 1 | 121253010001 | 50310727 | MTsS Hidayatullah Batakte | Swasta | Jln. Raya Tablolong Km. 14 Batakte | Batakte | Kupang Barat | Kupang |
| 2 | 121253010002 | 50310726 | MTsS Tarbiyatul Mualafin Tainbira | Swasta | Jalan Jurusan Oekabiti-Oemoro Rt. 11/06 Dusun Iii Desa Tesbatan | Tesbatan | Amarasi | Kupang |
| 3 | 121253010003 | 69995373 | MTsS Babussalam Oesao | Swasta | Jl. Timor Raya Km. 29 Kelurahan Oesao | Kelurahan Oesao | Kupang Timur | Kupang |
| 4 | 121253010004 | 70032992 | MTsS Darussalam Bajo Sulamu | Swasta | Jl Nurul Huda | Sulamu | Sulamu | Kupang |
| 5 | 121253020001 | 50310729 | MTsS Al-Ikhlas Soe | Swasta | Ikan Paus No. 16 Soe | Oe Kefan | Kota Soe | Timor Tengah Selatan |
| 6 | 121253020002 | 50310728 | MTsS Miftahuddin Oe Ekam | Swasta | Jl. Utama Oeekam | Oe’Ekam | Amanuban Timur | Timor Tengah Selatan |
| 7 | 121253020003 | 69853280 | MTsS Oeue | Swasta | Oeue | Mauleum | Amanuban Timur | Timor Tengah Selatan |
| 8 | 121253030001 | 50310730 | MTsS Nurul Falah Kefamenanu | Swasta | Kefamenanu Tengah | Kefamenanu Tengah | Kota Kefamenanu | Timor Tengah Utara |
| 9 | 121253040001 | 50310731 | MTsS Al-Mutmainnah Atambua | Swasta | Jl. No Amalo | Rinbesi | Atambua Selatan | Belu |
| 10 | 121153050001 | 50310736 | MTsN 1 Alor | Negeri | Jl. Banteng No. 1 Kalabahi | Kalabahi Timur | Teluk Mutiara | Alor |
| 11 | 121153050002 | 50310735 | MTsN 2 Alor | Negeri | Jln. Moh. Saleh No. 15 Baranusa | Baraler | Pantar Barat | Alor |
| 12 | 121153050003 | 50310733 | MTsN 3 Alor | Negeri | Tuan Lompo No. 01 Rt. 04/ Rw. 02 | Kabir | Pantar | Alor |
| 13 | 121253050001 | 50310734 | MTsS Babul Rahmad Kangge | Swasta | Bako No. 02 Kangge | Marisa | Pantar Baru Laut | Alor |
| 14 | 121253050002 | 50310732 | MTsS Darul Falah | Swasta | Jln. Raya Kokar Km. 09 | Dulolong | Alor Barat Laut | Alor |
| 15 | 121253050003 | 60727643 | MTsS Al-Hikmatul Bahri Ternate | Swasta | Ternate | Pulau Buaya | Alor Barat Laut | Alor |
| 16 | 121253050004 | 69941522 | MTsS Al-Islamiyah Bampalola | Swasta | Jl. Lahbo No. 2 | Bampalola | Alor Barat Laut | Alor |
| 17 | 121253050005 | 69941523 | MTsS Baburahman Aloindonu | Swasta | Aloindonu | Alila Selatan | Alor Barat Laut | Alor |
| 18 | 121253050006 | 69956018 | MTsS Insan Cita | Swasta | Jl. Kikilai | Moru | Alor Barat Daya | Alor |
| 19 | 121253050007 | 69977159 | MTsS Babul Rahmat Baolang | Swasta | Baolang | Baolang | Pantar | Alor |
| 20 | 121253050008 | 69977157 | MTsS Nurul Islam Banawiyah | Swasta | Batu Elang | Bana | Pantar | Alor |
| 21 | 121253050010 | 70026127 | MTsS Baiturrahman | Swasta | Kolijahi Rt 04 Rw 02 | Ombay | Pantar Timur | Alor |
| 22 | 121253050011 | 70044657 | MTsS Al Adibah Tula | Swasta | Tuabang | Batu | Pantar Timur | Alor |
| 23 | 121153060001 | 50310740 | MTsN 1 Flores Timur | Negeri | Jl. Trans Adonara-Kompleks Terpadu Min Lamahala Dan Mtsn Waiwerang | Lamahala Jaya | Adonara Timur | Flores Timur |
| 24 | 121153060002 | 50310742 | MTsN 2 Flores Timur | Negeri | Jl. Raya Lamakera Desa Watobuku | Watobuku | Solor Timur | Flores Timur |
| 25 | 121153060003 | 50310743 | MTsN 3 Flores Timur | Negeri | Jl. Ki Hajar Dewantoro | Lohayong Ii | Solor Timur | Flores Timur |
| 26 | 121153060004 | 50310745 | MTsN 4 Flores Timur | Negeri | Kompleks Terpadu Mis, Mas Dan Mtsn Witihama Desa Pledo | Pledo | Witihama | Flores Timur |
| 27 | 121253060001 | 50310741 | MTsS Nurul Falah Horowura | Swasta | Horinara | Horinara | Kelubagolit | Flores Timur |
| 28 | 121253060002 | 50310744 | MTsS Tarbiyah Lamawai | Swasta | Jl. Pasir Putih Rt 10 Rw 005 Dusun Riangkawukak Desa Lamawai | Lamawai | Solor Timur | Flores Timur |
| 29 | 121253060003 | 50310738 | MTsS Tarbiyah Sagu | Swasta | Sagu | Sagu | Adonara | Flores Timur |
| 30 | 121253060004 | 50310737 | MTsS Al-Hidayah Wewit | Swasta | Wewit | Wewit | Adonara Tengah | Flores Timur |
| 31 | 121253060005 | 50310739 | MTsS Al-Baraah | Swasta | Jalan Trans Adonara Km 4, Crowerian-Desa Duanur | Duanur | Adonara Barat | Flores Timur |
| 32 | 121253060006 | 60727645 | MTsS Al-Furqon | Swasta | Kompleks Terpadu Ra, Mis,Mts Al-Furqon Koli | Kolipetung | Adonara | Flores Timur |
| 33 | 121253060007 | 69881737 | MTsS Madinatunnajah | Swasta | Jl.Sultan Sahbuddin Menanga, Solor Timur. Rt/Rw : 003/002 | Menanga | Solor Timur | Flores Timur |
| 34 | 121253060008 | 69881736 | MTsS Al-Jihad Boleng | Swasta | Desa Boleng | Boleng | Ile Boleng | Flores Timur |
| 35 | 121253070001 | 50310746 | MTsS Muhammadiyah | Swasta | Jl. Diponegoro Nangahure Lembah | Wuring | Alok Barat | Sikka |
| 36 | 121253070002 | 50310747 | MTsS At-Taqwa | Swasta | Jl. Sultan Hasanuddin | Beru | Alok Timur | Sikka |
| 37 | 121253070003 | 50310748 | MTsS Nur Wahid | Swasta | Jl. Kesehatan No.19 | Gunung Sari | Alok | Sikka |
| 38 | 121253070004 | 50310750 | MTsS Muh Al Fatah Nanghale | Swasta | Jl. Masjid An Nur Blok L Nangahale | Nangahale | Talibura | Sikka |
| 39 | 121253070005 | 50310749 | MTsS Nur Muhammad | Swasta | Jl. Pendidikan | Pemana | Alok | Sikka |
| 40 | 121253070006 | 69956019 | MTsS Muhammadiyah Parumaan | Swasta | Parumaan | Perumaan | Alok Timur | Sikka |
| 41 | 121153080001 | 50305523 | MTsN 1 Ende | Negeri | Jl. Melati | Mautapaga | Ende Timur | Ende |
| 42 | 121153080002 | 50305527 | MTsN 2 Ende | Negeri | Jl. Kurma | Bokasape | Wolowaru | Ende |
| 43 | 121153080003 | 50305525 | MTsN 3 Ende | Negeri | Jl. Lintas Ende-Bajawa Km. 21 | Anaraja | Nangapanda | Ende |
| 44 | 121253080001 | 50305526 | MTsS Muhammadiyah Nangapanda | Swasta | Jl. Kakadupa, No. 9B | Ndorurea | Nangapanda | Ende |
| 45 | 121253080002 | 50305524 | MTsS Pp Walisanga Ende | Swasta | Jl. Ikan Duyung Puupui | Rukun Lima | Ende Selatan | Ende |
| 46 | 121253080003 | 50309144 | MTsS Nurul Ummah | Swasta | Kampung Baru | Renga Menge | Pulau Ende | Ende |
| 47 | 121253080004 | 69881738 | MTsS Nur Ikhsan Ndori | Swasta | Lianunu-Maubasa | Maubasa | Ndori | Ende |
| 48 | 121253080005 | 69977160 | MTsS Al-Ilmu Ende | Swasta | Jl. Imam Bonjol (Ndao) | Kota Ratu | Ende Utara | Ende |
| 49 | 121153090001 | 50310757 | MTsN Ngada | Negeri | Manurung | Nangamese | Riung | Ngada |
| 50 | 121253090002 | 50310756 | MTsS Darussalam | Swasta | Maumbawa | Kezewea | Golewa Selatan | Ngada |
| 51 | 121253090003 | 50310758 | MTsS Muhammadiyah | Swasta | Kampung Marotauk, Rt/Rw: 001/001 | Sambinasi Barat | Riung | Ngada |
| 52 | 121253090004 | 69977161 | MTsS Al-Hikmah Riung | Swasta | Kota Intan-Golokutu | Benteng Tengah | Riung | Ngada |
| 53 | 121153100001 | 50310760 | MTsN Manggarai | Negeri | Kompleks Pendidikan Barangkolo | Mata Air | Reok | Manggarai |
| 54 | 121253100001 | 50310759 | MTsS Amanah Ruteng | Swasta | Jl. Bengawan, Kel. Satar Tacik, | Satar Tacik | Langke Rembong | Manggarai |
| 55 | 121253100002 | 69881739 | MTsS An-Najah Reo | Swasta | Jl. Reo-Ruteng Komplek Pondok Pesantren Pancasila Reo | Mata Air | Reok | Manggarai |
| 56 | 121253100003 | 70006798 | MTsS Fatimah Nangapaang | Swasta | Nanga Paang | Legu | Satar Mese | Manggarai |
| 57 | 121153110001 | 50310724 | MTsN Sumba Timur | Negeri | Jl. Sultan Agung No. 36 | Kamalaputi | Kota Waingapu | Sumba Timur |
| 58 | 121253110001 | 50310725 | MTsS Al Istiqomah Melolo | Swasta | Jl. Melolo – Kananggar Km. 2 | Watuhadang | Umalulu | Sumba Timur |
| 59 | 121253110002 | 69994462 | MTsS Al-Muhajirin Tanaraing | Swasta | Jln. Makarti-Tanaraing | Tanaraing | Rindi | Sumba Timur |
| 60 | 121253110003 | 70006891 | MTsS Nurul Fikri | Swasta | Jl. Jawamara Pametikarata Lewa | Lewa Paku | Lewa | Sumba Timur |
| 61 | 121153120001 | 50310723 | MTsN Sumba Barat | Negeri | Jl. Kereloko | Wailiang | Kota Waikabubak | Sumba Barat |
| 62 | 121153130001 | 50310761 | MTsN 1 Lembata | Negeri | Jln. Mas Sarabiti Kalikur Buyasuri | Kalikur | Buyasuri | Lembata |
| 63 | 121153130002 | 50310763 | MTsN 2 Lembata | Negeri | Trans Lembata No. 12 | Selandoro | Nubatukan | Lembata |
| 64 | 121153130003 | 50310762 | MTsN 3 Lembata | Negeri | Jl. Trans Umaleu | Umaleu | Buyasuri | Lembata |
| 65 | 121253130002 | 50310764 | MTsS Al-Muhajirin Hingalamamengi | Swasta | Jl. Simpang Raya Hingalamamengi | Hingalamamengi | Omesuri | Lembata |
| 66 | 121253130003 | 69963507 | MTsS Nurul Kawaakib | Swasta | Jalan Trans Kedang – Desa Atuwalupang – | Atu Wa’Lupang | Buyasuri | Lembata |
| 67 | 121253130004 | 69963508 | MTsS Al-Hidayah Ile Ape | Swasta | Jl. Trans Lembata-Ile Ape | Waowala | Ile Ape | Lembata |
| 68 | 121253130005 | 69977162 | MTsS Nur Salam Kolipadan | Swasta | Jl. Trans Ile Ape-Desa Kolipadan | Kolipadan | Ile Ape | Lembata |
| 69 | 121253140001 | 50310765 | MTsS Al-Muhajirin | Swasta | Jl. Toko-Pepela No. 15 | Papela | Rote Timur | Rote Ndao |
| 70 | 121253140002 | 69977163 | MTsS Nurul Ikhwan Ba’A | Swasta | Metina | Metina | Lobalain | Rote Ndao |
| 71 | 121153150001 | 50310769 | MTsN Manggarai Barat | Negeri | Jl. Nangalili-Kendol | Nanga Lili | Lembor Selatan | Manggarai Barat |
| 72 | 121153150002 | 50310766 | MTsN 2 Manggarai Barat | Negeri | Jl. Puncak Waringin | Labuan Bajo | Komodo | Manggarai Barat |
| 73 | 121253150002 | 50310771 | MTsS Nurul Miraj | Swasta | Ndewel | Golo Ndoal | Mbeliling | Manggarai Barat |
| 74 | 121253150003 | 50310770 | MTsS Jabal Nur | Swasta | Watu Lendo | Siru | Lembor | Manggarai Barat |
| 75 | 121253150004 | 50310767 | MTsS Al-Arsy | Swasta | Jln. Puala Ida No. 2 Terang Desa Golo Sepang | Golo Sepang | Boleng | Manggarai Barat |
| 76 | 121253150005 | 50310772 | MTsS Al-Iqra | Swasta | Desa Golo Mbu | Golo Mbu | Sano Nggoang | Manggarai Barat |
| 77 | 121253150006 | 50310768 | MTsS Ar-Rahman | Swasta | Merombok | Golo Bilas | Komodo | Manggarai Barat |
| 78 | 121253150007 | 69822462 | MTsS Al Muhtadin | Swasta | Joneng,Rt/Rw:004/002,Desa Benteng Dewa | Benteng Dewa | Lembor Selatan | Manggarai Barat |
| 79 | 121253150008 | 69822464 | MTsS Nurul Taufik | Swasta | Jln Desa Bari | Bari | Macang Pacar | Manggarai Barat |
| 80 | 121253150009 | 69956020 | MTsS Al Istiqomah | Swasta | Raong | Golo Mori | Komodo | Manggarai Barat |
| 81 | 121253150010 | 69956021 | MTsS Al Mukhsinin Pandang | Swasta | Jl.Raya Malawatar – Pandang, | Tangge | Lembor | Manggarai Barat |
| 82 | 121253150011 | 69977164 | MTsS Hidayatullah Mburak | Swasta | Mburak,Translok | Macang Tanggar | Komodo | Manggarai Barat |
| 83 | 121253150012 | 69983225 | MTsS Insan Kamil Nggorang | Swasta | Nggorang | Nggorang | Komodo | Manggarai Barat |
| 84 | 121153160001 | 50310773 | MTsN Nagekeo | Negeri | Jl. Jenderal Soeharto | Mbay I | Aesesa | Nagekeo |
| 85 | 121253160001 | 50310774 | MTsS Nurussaadah Maropokot | Swasta | Poros Danga-Maropokot | Marapokot | Aesesa | Nagekeo |
| 86 | 121253160002 | 50310776 | MTsS An-Nahl Nangaroro | Swasta | Jl. Nangaroro-Maunori | Nangaroro | Nangaroro | Nagekeo |
| 87 | 121253160003 | 50310775 | MTsS Nurul Hidayah Mauwaru | Swasta | Jl. Lintas Mauponggo-Maumbawa | Lokalaba | Mauponggo | Nagekeo |
| 88 | 121253160004 | 69977165 | MTsS Al-Hikmah Keo Tengah | Swasta | Maundai | Udiworowatu | Keo Tengah | Nagekeo |
| 89 | 121253160005 | 70030184 | MTsS Al-I’Tisham Mbay | Swasta | Jalan Kh. Agus Salim, Lingkungan Kolikapa | Mbay I | Aesesa | Nagekeo |
| 90 | 121253170001 | 60727648 | MTsS Al-Jihad | Swasta | Mananga | Wendewa Utara | Mamboro | Sumba Tengah |
| 91 | 121253180001 | 60727647 | MTsS Al-Falah Tambolaka | Swasta | Jl. Watutakula-Desa Radamata | Rada Mata | Kota Tambolaka | Sumba Barat Daya |
| 92 | 121253180002 | 60727646 | MTsS Al-Hidayah Kodi | Swasta | Jl. Pantai Pero Desa Pero Konda | Pero Konda | Kodi | Sumba Barat Daya |
| 93 | 121153190001 | 50310780 | MTsN Manggarai Timur | Negeri | Jln. Lintas Utara | Pota | Sambi Rampas | Manggarai Timur |
| 94 | 121153190002 | 50310777 | MTsN 2 Manggarai Timur | Negeri | Jl. Muhammad Hatta | Rana Loba | Borong | Manggarai Timur |
| 95 | 121253190001 | 50310778 | MTsS Nurul Amin Elar | Swasta | Rangke | Biting | Elar | Manggarai Timur |
| 96 | 121253190002 | 50310779 | MTsS Al-Hikmah Lamba Leda | Swasta | Jl. Lintas Utara Reo-Pota Flores/Ronting | Satar Kampas | Lamba Leda | Manggarai Timur |
| 97 | 121253190003 | 50310781 | MTsS Al-Qalam Tompong | Swasta | Jln. Lintas Utara Flores | Nampar Sepang | Sambi Rampas | Manggarai Timur |
| 98 | 121253190004 | 50310782 | MTsS Al-Falahiyah Nanga | Swasta | Jl. Watunggong-Elar | Golo Ngawan | Sambi Rampas | Manggarai Timur |
| 99 | 121253190006 | 50310783 | MTsS Ar-Rahimiyyah Pota | Swasta | Pota | Pota | Sambi Rampas | Manggarai Timur |
| 100 | 121253190007 | 70028087 | MTsS Jabalur Rahmat | Swasta | Jalan Lintas Selatan Elar | Compang Soba | Elar | Manggarai Timur |
| 101 | 121253190008 | 70042738 | MTsS Nurul Falaq Lengko Randang | Swasta | Lengko Randang | Nanga Baur | Sambi Rampas | Manggarai Timur |
| 102 | 121253210001 | 69977166 | MTsS Al-Qadr Betun | Swasta | Jl. Pasar Baru, Betun | Wehali | Malaka Tengah | Malaka |
| 103 | 121153710001 | 50310784 | MTsN Kota Kupang | Negeri | Jln. Sangkar Mas No.15 Kel. Nunbaun Sabu | Nunbaun Sabu | Alak | Kota Kupang |
| 104 | 121253710001 | 50310785 | MTsS Nurul Iman | Swasta | Jl. Hati Mulia Vi | Oebobo | Oebobo | Kota Kupang |
| 105 | 121253710002 | 69977167 | MTsS Al Baaitul Qadim Airmata | Swasta | Jl. Trikora | Airmata | Kota Lama | Kota Kupang |
